ABBYY의 FineReader나 FlexiCapture 사용해 보세요. 써본 지 꽤 됐지만, 사진 여러 장 대충 늘어놓고 스캔해도 똑바로 정렬해 주는 기능도 있고, 말씀하신 기능도 가능하지 싶네요. 옵션이 워낙 다양하기도 하지만 기능도 나름 막강한 툴입니다. <br />
http://abbyy.diotek.co.kr/?ui=abbyy_main&gclid=COD98JH_154CFShSagod1RLqrQ
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